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  • Complete Genomes in KEGG
     大腸菌,線虫,ショウジョウバエを始めとして20を越える生物のゲノム塩基配列のリスト
  • Ensembl Project
     配列に関する総合的なデータベース
  • Entrez Genome
     ゲノム配列のデータベース
  • GEO : Gene Expression Omnibus
     NCBIが提供するフィルターハイブリダイゼーション・マイクロアレイ・DNAチップなどから得られる発現データを蓄積し公開することを目的としているサービス
  • GOLD : Genomes On Line Database
     世界各地で行われている塩基配列決定の進行状況がわかる
  • HOWDY(Human Organized Whole Genome Database)
     科学技術振興事業団のHOWDY(Human Organized Whole genome Database:ヒトゲノム情報統合データベース)
  • The Cancer Genome Anatomy Project(CGAP)
     種々の臓器における正常,前癌,癌の各細胞で発現している遺伝子をカタログ化し,癌化の機構を遺伝子レベルで解析しようという試み
  • CEPH
     遺伝子型データベース
  • The Human Gene Mutation Database(HGMD)
     ヒトゲノムの変異に関するデータベース
  • ゲノムネット
     京都大学化学研究所バイオインフォマティクスセンターが提供するゲノムデータベース

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セルバンク・ジーンバンク

  • DSMZ Home Page
     DSMZ(Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen GmbH)のホームページ
  • JCRB生物資源バンク
     医薬基盤研究所が運営する5つ(細胞,ヒト組織,日本人由来B細胞株・DNA,遺伝子クローン,実験動物)の生物資源バンク

遺伝子・遺伝子変異関連データベース

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データ解析サイト・ツール

  • BCM Home
     Baylor College of MedicineのHuman Genome Centerが提供している分子生物学研究用解析ツール集
  • BioToolKit
     BioSupplyNetにある研究用ツール・データベースサイトへのリンク集
  • Computational Molecular Biology at NIH and Beyond
     NIHが提供する分子生物学関連の分析ツールサイト,データベースサイト等へのリンク
  • Compute pl/Mw tool
     タンパク質のアミノ酸配列から等電点を予測するツール
  • CDART : Concerved Domain Architecture Retrieval Tool
     ドメイン構造をデータベース(CDD)と比較して,類似のドメイン構造をもつタンパク質と並べることで機能を予測する解析ツール
  • Ensembl Genome Server
     EMBL-EMBL-EBIとSanger Centreが共同で運営するゲノムデータ解析サイト
  • European Bioinformatics Institute(EBI)
     GeneBankとDDBJと共同で核酸・タンパク質に関するデータベース,バイオインフォマティクスに関するツールを提供
  • European Molecular Biological Labolatory(EMBL)
     BLASTなどの基本的な配列解析ツール
  • ExPASy Proteomics Server
     Swiss Institute of Bioinformaticsの提供しているSWISS-PROTのタンパク質・遺伝子解析ツール集サイト
  • Folding@home
     タンパク質のフォールディングの解析ソフトを提供
  • NCBI BLAST
     NCBIによるホモロジー検索ができるサーバ
  • ProteinProspector
     ブラウザ上で利用できる質量分析ツール集サイト.MS-Fit,MS-Tag,MS-Seqなど
  • PSORT
     タンパク質の細胞内の局在化を予測するプログラム
  • RasMol
     PDBに登録されている結晶解析のデータ(pdf形式のファイル)から立体構造を表示
  • REBASE Tools
     制限酵素で切断された断片のゲル電気泳動パターンをシミュレーションできる
  • The CMS Molecular Biology Resource
     分子生物学・生物工学・生化学・分子進化学・生体分子モデリングに関したツールサイトのリンク集

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